柴油发电机的配气机构零件磨损或损坏时，将破坏配气定时，使气门开度减小，尤其是气门与气门座的密封不严时，由于漏气而使汽缸压缩力降低，造成柴油发电机功率下降，燃料消耗量增加。常见的故障如下：
 
（1）气门关闭不严
主要原因是气门与气门座由于磨损、积炭、烧蚀使接触表面贴合不好而造成的。另外，气门杆弯曲或在导管中粘住，气门弹簧折断或弹力不足，气门间隙调整过小等均会使气门关闭不严。气门不漏气情况，可以用检测汽缸压缩压力的方法初步判断，若汽缸压缩压力低，可在汽缸中注入少许机油再检查一次，这时仍旧压力低，运转时有进气管回火和排气管放炮现象（对汽油机而言），就说明漏气。若发现气门漏气，应及时检修和排除。
（2）气门间隙大
其原因除了气门间隙调整过大以外，主要是气门间隙调节螺钉松动或凸轮、气门挺杆等配气机构零件的正常磨损造成的。此时，必须重新进行调整或检修。
（3）气门杆卡住
由于气门杆与气门导管配合间隙选择不当，或导管内出现积炭现象，以及气门杆弯曲等造成。因此，在使用维护过程中必须严格按照配合间隙要求进行选配，并防止导管内产生积炭。若发现气门杆弯曲变形应更换气门。
（4）气门断裂
气门断裂一般发生在头部与杆部过渡区域的杆部环槽处。气门断裂落入汽缸内，便造成活塞顶缸重大事故。造成气门断裂的主要原因一般是由于柴油发电机温度过高，突然冷却，气门上温度分布不均产生热应力所造成的，或由于进、排气门装错，造成变形、断裂。在使用维护过程中，应严格保持气门与导管的正常配合间隙，保证气门落座准确。在检修时要仔细检查气门是否有扭曲变形和裂纹存在，以防止气门断裂引起重大事故。
（5）气门弹簧断裂
气门弹簧断裂不仅破坏柴油发电机正常工作，也会使气门落入汽缸内造成严重事故。造成原因是结构和材料及加工不合格，工作过程中发生变形等。在拆修时，应将气门弹簧清洗干净，仔细检查表面是否有裂纹或严重锈蚀现象，并放在平台上检查是否有立不直或扭曲现象，若有上述现象存在应立即更换。另外，由于工作时间过长引起弹簧弹力不足，也会造成气门漏气等现象，所以弹簧弹力不足时也应及时更换。
（6）汽缸盖损坏
故障现象：某个汽缸有功率损失，排气冒白烟，冷却液损失，有时汽缸垫漏气。
诊断方法：这种故障通常伴有汽缸盖开裂或可能翘曲。汽缸盖开裂也可能会导致冷却液进入燃烧室，从而导致排气冒白烟。另外，翘曲的汽缸盖可能导致汽缸垫漏气。这两个故障都会导致某个汽缸的功率损失。通过进行湿式和干式压缩试验就可以诊断出这种故障。
维修方法：
① 拆下汽缸盖，检查各个燃烧室和气门导管之间是否可能有裂纹。在大多数情况下，只有用钢丝刷将这些部位清洗干净，才能看到裂纹。裂纹可能很小，有时很难发现。
② 用直尺和塞尺检查汽缸盖是否翘曲。具体步骤如下：
● 先清洗汽缸盖，除去灰尘和油脂。
● 将钢直尺横跨在汽缸盖上。

用直尺和塞尺检查汽缸盖的平直度
 
● 尝试着在汽缸盖和直尺之间滑动塞尺，这些地方显示汽缸已经翘曲。开始时使用0.03mm的塞尺，如果可能，接着再使用更厚一点的塞尺。沿着汽缸盖的长度方向、宽度方向对角线方向检查翘曲度。典型的最大翘曲规范是：在6in长度内翘曲量为0.003 in，或整个长度内为0.007in。不是所有的制造厂都具有相同的翘曲规范。一般的，最大翘曲量在0.003～0.007in之间。
● 如果汽缸盖的翘曲量超过了制造厂的规范，可以对汽缸盖进行加工。这个过程称作铣缸盖。一般专业加工机间都有合适的工具铣削汽缸盖。如果汽缸盖被铣削过（大约：010in），压缩比将稍稍增大。对于顶置凸轮轴发动机，铣削汽缸盖可能会改变凸轮轴传动比或链条的张紧度。